Qua kiểm tra, hầu hết các tổ chức tham gia BHTG chấp hành tương đối tốt các quy định của pháp luật về BHTG trong việc niêm yết Chứng nhận BHTG, Nội dung của việc BHTG; về chấp hành chế độ thông tin báo cáo và tính phí BHTG. Tuy nhiên, vẫn còn một số Ngân hàng chưa thực hiện tốt các quy định về BHTG trong việc thực hiện thủ tục đề nghị cấp Chứng nhận BHTG khi thay đổi nội dung hoạt động theo quy định tại khoản 3 Điều 7 Nghị định số 68/2013/NĐ-CP ngày 28/6/2013 của Chính phủ về Bảo hiểm tiền gửi; Hạch toán tiền gửi chưa đúng quy định của NHNN; chưa xác định đúng đối tượng tiền gửi được bảo hiểm.
Kết quả kiểm tra phí BHTG khối NHTM có 05 NH nộp thiếu số tiền là 21,8 triệu đồng,08 NH thừa phí số tiền là 74,7 triệu đồng; Khối QTDND có 26 QTD nộp thừa 23,2 triệu đồng, 12 QTD nộp thiếu số tiền 13,4 triệu đồng. Nguyên nhân chủ yếu trong việc tính thừa thiếu phí BHTG do chưa xác định đúng đối tượng tiền gửi được bảo hiểm; hạch toán tiền gửi của tổ chức vào tiền gửi tiết kiệm.
Bên cạnh việc phát hiện những sai sót của các tổ chức tham gia bảo hiểm trong việc chấp hành các quy định của Nhà nước về BHTG, các Đoàn kiểm tra đã chỉ ra những tồn tại, sai sót cụ thể của từng đơn vị, tư vấn, hướng dẫn giúp đơn vị chỉnh sửa, khắc phục kịp thời, đồng thời thực hiện tuyên truyền, hướng dẫn các đơn vị nắm bắt, triển khai những quy định mới về Luật BHTG và các văn bản hướng dẫn Luật. Từ đó, giúp các tổ chức tham gia BHTG nâng cao hơn ý thức, trách nhiệm trong việc chấp hành các quy định của pháp luật về BHTG và đảm bảo an toàn hoạt động ngân hàng, và quan trọng hơn đã củng cố niềm tin của người gửi tiền đối với hệ thống ngân hàng.