Qua kiểm tra cho thấy các đơn vị đã triển khai thực hiện nghiêm túc việc chấp hành cơ chế chính sách của Bảo hiểm tiền gửi Việt Nam cơ bản đầy đủ, kịp thời; niêm yết Chứng nhận BHTG đúng mẫu quy định, vị trí niêm yết đạt yêu cầu truyền tải thông tin, người gửi tiền dễ nhìn thấy nội dung của chứng nhận BHTG; việc thực hiện các kiến nghị lần kiểm tra trước các đơn vị đã chấp hành nghiêm túc đầy đủ đúng tiến trình...; việc xác định số dư tính phí BHTG, thực hiện hạch toán các kỳ nộp phí BHTG của các đơn vị phần đa đảm bảo đầy đủ, chính xác, kịp thời; các chỉ tiêu đảm bảo an toàn trong hoạt động ngân hàng phần đa cơ bản đáp ứng tốt yêu cầu đề ra, chất lượng tín dụng đảm bảo và có mức độ rủi ro thấp. Tuy vậy, vẫn còn một số tồn tại như hồ sơ tín dụng, trích lập dự phòng rủi ro, công tác kiểm soát,…của QTD là chưa đúng với quy định hiện hành; số dư để tính phí của một số kỳ nộp phí BHTG có chênh lệch so với số liệu của đoàn kiểm tra, cụ thể: có 15 đơn vị nộp thừa phí BHTG số tiền: 861 nghìn đồng; 10 đơn vị nộp thiếu số tiền: 4.923 nghìn đồng.
Những tồn tại vướng mắc được chỉ ra và sự tư vấn từ phía đoàn kiểm tra đã giúp đơn vị khắc phục, chỉnh sửa những hạn chế và sai sót trong quá trình thực hiện các quy định về BHTG, các chỉ tiêu an toàn trong hoạt động ngân hàng với mục tiêu giúp đơn vị phát triển an toàn hiệu quả .
Để công tác kiểm tra được cập nhật hơn, hầu hết các đơn vị đã kiến nghị với BHTGVN nên tiến hành kiểm tra định kỳ hàng năm nhằm tạo điều kiện thuận lợi cho đơn vị trong việc cung cấp số liệu và việc tính nộp phí BHTG ngày càng hoàn thiện. Đồng thời nên thu phí BHTG theo mức độ rủi ro để các đơn vị tham gia BHTG tích cực nâng cao chất lượng hoạt động đảm bảo an toàn vốn; nâng mức chi trả tiền được bảo hiểm (hiện nay mức chi trả 50 triệu đồng là quá thấp)phù hợp với mức sống và thu nhập bình quân của người dân nhằm nâng cao niềm tin của người gửi tiền vào các tổ chức tín dụng, thuc đẩy công tác huy động vốn.